Untuk dua sistem berkomunikasi menggunakan IPsec, masing-masing mesti mempunyai sambungan yang ditentukan yang mengandungi alamat IP, mengenal pasti nama host, kunci RSA dan rangkaian peribadi (jika ada) kedua-dua sistem tersebut. Setiap sambungan yang dikonfigurasi akan muncul sebagai ikon di halaman utama modul. Selalunya butiran konfigurasi yang anda masukkan semasa membuat sambungan akan sama pada kedua sistem, hanya dengan pertukaran bahagian tempatan dan jarak jauh . Setiap hos yang ingin berkomunikasi menggunakan IPsec mesti mempunyai pasangan kunci awam / peribadi, digunakan untuk penyulitan dan pengesahan. Setiap hujung sambungan mesti mengetahui kunci awam hujung yang lain, yang boleh disimpan dalam tetapan sambungan atau mencari dari pelayan DNS. Ciri Tunjukkan Kunci Awam modul ini boleh digunakan untuk memaparkan kunci hos ini.
IPsec lebih kompleks untuk mengatur protokol VPN lain, tetapi lebih selamat dan berkemampuan, dan dianggap sebagai standard industri. Sayangnya, terdapat banyak ralat konfigurasi yang boleh anda buat yang menyebabkan sambungan anda gagal dimulakan, atau secara senyap-senyap gagal mengarahkan lalu lintas. Walaupun modul ini melindungi anda dari kesalahan mudah, modul ini tidak dapat menyelamatkan anda dari masalah konsep yang lebih serius.
Sekiranya anda menggunakan FreeSWAN versi 2, anda juga akan melihat ikon untuk mengedit pelbagai fail polisi yang menentukan jenis komunikasi (yang dienkripsi atau jelas) yang akan digunakan untuk berbagai rangkaian. Biasanya ini boleh dibiarkan tidak berubah, kerana lalai adalah menyulitkan bila boleh.
Di bahagian bawah halaman terdapat butang untuk memulakan atau menghentikan proses pelayan FreeSWAN, dan menerapkan tetapan semasa ketika sedang berjalan. Sistem anda tidak akan dapat membuat atau menerima sambungan IPsec melainkan pelayan aktif. Butang Mula Sambungan di bahagian ini dapat digunakan untuk memaksa pembentukan terowong IPsec yang tidak dibawa secara automatik ketika pelayan dimulakan.