Varsayılan olarak, bir web sitesi FTP kullanıcısı için ana dizin, etki alanının temel web diziniyle aynıdır. Ancak, bunu etki alanının ana dizinine (boş bir değer kullanarak) veya bir alt dizine (web dizininin altında göreli bir yol kullanarak) değiştirebilirsiniz. Bu, FTP sunucusunun istemcileri kendi ana dizinleriyle sınırlayacak şekilde yapılandırıldığını varsayar; bu, standart Virtualmin kurulumlarında varsayılan değer olmalıdır.