Dosya Yöneticisi (sadece ana dizin) Dosya Yöneticisi, sunucunun dosya sisteminin çift bölmeli görünümünü sunan gelişmiş bir Java uygulamasıdır. Webmin'in en güçlü özelliklerinden biridir ve deneyimsiz kullanıcıların bile dosyaları, dizinleri ve izinleri yönetmesine, metin dosyalarını düzenlemesine, dosyaları karşıya yüklemesine ve indirmesine ve daha fazlasına olanak tanır. Varsayılan olarak, etki alanı sahibi yalnızca kendi dizinine ve alt dizinlerine erişebilir.