CGI komut dosyalarını kullanarak çalıştırın fcgiwrap sunucusu kurulduğunda, bu seçenek, yeni etki alanları için CGI komut dosyalarını çalıştırmak için her zaman kullanılıp kullanılmayacağını seçmenize olanak tanır. Aksi takdirde, suexec doğru şekilde kurulmuş ve yapılandırılmışsa kullanılacaktır. FCGIwrap genellikle CGI betiklerini çalıştırmak için daha hızlıdır, ancak her sanal sunucunun ek RAM tüketen kendi sunucu sürecini çalıştırmasını gerektirir.